黃瓜細菌性病害發生不如角斑病普遍和常見。主要是細菌性葉枯病和細菌性緣枯病。其中細菌性葉枯病近年有所發生。此病癥狀比較容易辨認。主要為害葉片，葉正面出現退綠的黃綠色圓斑，葉背面初呈水浸狀退綠斑。病斑處變薄、白色、灰白色、黃色和黃褐色。有時病葉背面可見于菌膿。幼莖染病，病莖開裂。果實上形成圓形灰色斑點，其中有黃色干菌膿。
細菌性葉枯病為高溫高濕型病害。一般種子帶菌，病殘體也帶菌。當葉緣吐水或葉片結露時，病菌由水孔侵入，傷口也可侵入。病菌通過維管束傳播。
細菌性緣枯病，發病從植株下部葉片開始，向上蔓延。多數病斑由葉緣向內發展，形成“V”字形的大病斑，灰白色或淡褐色。并逐漸連成沿葉緣的枯斑，還有的病斑出現在其余部位，也不規則。病斑很少龜裂或穿孔，但質脆干枯，莖、葉柄和卷須上的病斑為褐色水漬狀。瓜條從柄處開始呈現褐色水漬狀、凋萎、失水后僵硬，當空氣濕度大時病部溢出菌膿。
細菌性緣枯病菌可由種子傳播，土壤中的病殘體為初侵染源。溫室的晝夜溫差較大，容易引起葉面結露，葉緣吐水，也有利于這種病害的發生，病菌經菌膿傳播或人的操作進行傳播。
防治細菌性葉枯病和細菌性緣枯病，應首先做好種子消毒，將種子上可能帶的病菌殺滅，播種前用55℃的溫水浸種20分鐘，撈出晾干后催芽或播種，或用800倍高錳酸鉀溶液浸種15-20分鐘；或100萬單位農用鏈霉素500倍液浸種2小時，沖洗干凈后催芽、播種。
其次是控制溫室內的濕度，采用膜下灌或滴灌的給水方式，降低相對濕度。而發病后對部分下部非功能病葉可摘除，并深埋處理。拔園后徹底處理殘體。發病初期及時噴藥，用77%可殺得可濕性微粒粉劑500倍液、12%綠乳銅乳油500倍液、47%加瑞農可濕性粉劑500倍液，20%龍克菌水懸浮劑（成分為噻菌銅）。噴霧為600倍液。5-7天1次，連續用3-4次。
