(1)空氣濕度高，注意病害發生。棚室的氣密性好，提高了溫度，同時也增大了棚室內的濕度，特別在低溫期，極易使作物表面結露或吐水，為真菌、細菌性病害的發生、發展創造了條件。如低溫高濕時容易發生灰霉病、細菌性角斑病、霜霉病等，高溫高濕時易發生葉霉病等，這些已成為棚室蔬菜的主要病害。在保溫的基礎上，通風排濕，減少棚室內結露時間和結露量，是病害綜合防治措施中的首要一條。
(2)土地輪作困難，注意土傳病害的防治。由于棚室面積有限及栽培品種單調，給蔬菜倒茬輪作帶來困難，有相當一部分棚室多年連作一二種蔬菜，不僅造成土壤營養不良，而且使土壤中病菌量增多，土傳病害猖獗，如黃瓜枯萎病、茄子黃萎病及根結線蟲等，嚴重影響蔬菜的生長。因此，要重視輪作倒茬、重視清潔和消毒土壤，以減少病害的發生和發展。
(3)土壤鹽漬化嚴重，注意合理施肥。棚室中的土壤養分不會隨雨水流失，加之化學肥料用量較大，致使土壤中鹽離子濃度升高，鹽漬化嚴重，根的滲透壓增大，影響了根對水分、養分的吸收而造成鹽害。為了防止鹽漬化，應盡量多施有機肥料，測土配方使用化肥，少施氯化物和硫化物類化肥，并應采取條施或穴施，避免表面撒施。施用氮素化肥時應采用穴施或開溝施，然后覆土澆水，并加強通風，預防氨氣中毒。施入的有機肥要完全腐熟。如發現出現鹽害，可用大水或雨水沖洗土壤中積存過多的鹽分。
(4)光照強度低，注意改善光照條件。棚室的結構設計、骨架及覆蓋的塑料薄膜等，是影響光照強度的主要因素。要經常清掃或清洗棚膜、覆蓋草苫的溫室，更要清掃膜面的草屑和灰塵。大棚膜一般可用柔軟的粗麻繩，兩人分別站在東西兩邊拉動麻繩，來回擦抹薄膜表面，并用自來水噴灑，沖洗灰塵。棚室內應盡量減少支柱，棚室采光角要適當，以增加采光量。在栽培上盡量選擇耐弱光品種，種植密度要適宜，并利用搭架或吊蔓栽培，隨時摘除底部的黃、老、病等無效葉片，及時綁蔓、打權，充分利用棚內的有限光照。
(5)投資多，成本高，注意精耕細作提高效益。棚室栽培蔬菜投資多、成本高，要及時掌握市場動態，科學調整種植結構和技術，充分利用土地和空間，加強栽培管理和病蟲害的防治，壓縮一切開支，奪取蔬菜高產、優質，以期獲得最好的經濟效益。
