農業防治是利用農業生產技術對作物生態系統加以調整，創造有利于作物生長、而不利于病蟲害增長繁殖的環境條件，避免或減輕病蟲等有害生物對蔬菜生產的危害。這主要包括以下方面內容：
(1)引進、選育和推廣抗病蟲害的優良品種，因地制宜選用抗病品種
選用抗性品種是防治病蟲害經濟、有效的方法。選用抗性品種時要注意，作物的抗性表現因地而異，在應用時要因地制宜選用品種，并掌握品種的栽培要點，充分發揮抗性品種的性能和特點。無公害蔬菜生產中品種的選擇是重要的生產環節。選用抗病蟲品種可以減少病蟲的危害，減少農藥和化肥的施用次數，從而減少農藥在蔬菜產品上的殘留量，也減少了生產所需的藥劑成本，保證了蔬菜的安全衛生，從而達到無公害要求，獲得較好的經濟效益和社會效益。另外，對于一些其他方法難以防治的病害，如枯萎病、疫病、青枯病等，選用抗性品種往往是最重要和最經濟的方法。
(2)選用無病蟲種子，培育無病蟲種苗
通過建立無病蟲種菜田和苗圃，減少種苗帶病或帶蟲。貯存期的種子必須控制含水量，以防止種子霉變。播種前要對種子進行必要的消毒處理，結合藥劑拌種、浸種，也可選擇經包衣劑處理的種子。
(3)對育苗場所進行消毒
許多蔬菜病蟲害可以通過土壤傳染菜苗形成對蔬菜的侵染危害，為了培育壯苗，必須進行必要的苗床消毒。通常使用溴甲烷熏蒸，對苗床進行消毒處理，或采用石灰、敵克松和福爾馬林等作為土傳病菌的消毒劑，用毒死蜱、殺蟲雙等殺蟲劑對土傳害蟲進行消毒處理。
另外，采用營養缽或育苗盤進行育苗也是培育無病蟲種苗的一項措施。育苗土必須經過消毒處理后才能使用。
(4)適時播種和移植，加強田間管理
