把馬糞溫床設在日光溫室或大棚里，為棚室蔬菜培育秧苗，是近幾年來寒冷地區棚室蔬菜育苗的一項改革，比架床育苗溫度狀況好，可作播種床，也可以育成苗，育苗的效果與電熱溫床相近，但不用電，設備簡單，成本低，凡有馬糞的地方均可采用。
馬糞溫床由床坑、生馬糞、床土、塑料小拱棚和紙被或草苫子構成，利用生馬糞發酵產生的生物熱提高床溫。
在日光溫室或大棚里選陽光和溫度狀況好的部位設置馬糞溫床。按寬1.5米左右、長7-10米的長方形放線，挖深25 -40厘米的平底床坑，把化好的生馬糞分2-3層踩入床坑。據各地氣候條件、棚室的保溫能力和不同種類蔬菜對溫度的要求，踩入馬糞的總厚度至少也要20厘米以上，踩薄了基本不發酵，只起隔涼作用，寒冷地區應踩35厘米厚以上。踩入之前把生馬糞在棚室內烤化，最好能達到l0℃左右再踩入床坑內，踩入后易發酵。踩入的生馬糞還應有適宜的含水量，太干了發酵過快，不持久，太濕了發酵太慢，床溫遲遲上不來，以用腳踩后剛能濕鞋底為宜。
如果不濕鞋底，應當噴些水后翻混均勻，若太濕應把生馬糞在棚室內翻曬，以降低其含水量。踩完生馬糞后扣上塑料拱棚，白天烤曬，夜間蓋上紙被、草苫子等保溫。當生馬糞在床內開始發酵時填入床土。頭一星期左右馬糞發酵升溫快，床土溫度能達到30℃以上，這時不宜播種，待床土溫度穩定在25℃以下時再播種，馬糞溫床也可以擺分苗后的苗缽育成苗。適合寒冷季節培育喜溫果菜秧苗。
