4、疾病的預防：工廠化養殖一般是水體小、密度大，疾病預防非常重要，要確保不能有疾病發生，否則容易全軍覆沒。主要采取以下措施：
a、要選擇健康沒有疾病史的魚放入養殖池。
b、在入池之前要進行消毒處理。
c、嚴格控制水處理工藝過程，在處理系統設置消毒殺菌設備。
d、在養殖過程中注意環境變化對魚類的脅迫壓力。包括各種水質的干擾波動、水溫的變化等。脅迫壓力大，將使魚類的抗病能力降低。
e、注意投餌的科學性，避免魚類過食現象，魚類過食也增加魚類負擔，容易生病。
f、使用專用工具，并經常消毒。
五、發展工廠化養魚注意事項
目前，我國對工廠化養殖的研究還遠遠落后于世界水平，有關理論體系和技術體系還很不完善。工廠化養魚是高效益、高技術、高投入、高風險的產業，企業有興趣要發展的話應量力而行，根據自身具體條件，選準養殖對象、養殖設施和開發基地，發揮當地的自然優勢和技術優勢，對采用的技術路線、生產成本及效益、經營風險等方面進行科學、嚴謹、客觀地分析論證。
1、工廠化養魚的初期投入較高，因此發展工廠化養魚的品種選擇及前期的調研工作非常重要，投資一定要慎重。
2、相對于傳統的養殖方式，工廠化養魚是新興事物，技術含量較高，因此養殖企業需要一支高文化高素質、懂技術懂操作的隊伍。否則，即使有再好的設施和技術，也只能以失敗而告終。
3、相關單位應聯合攻關。工廠化養魚涉及環境、餌料、育種、病害、養殖、工程、機電自動化等學科，是一個綜合性的系統工程，單靠企業單兵作戰，難以承擔經營風險和實現社會效益、企業效益的統－。因此，政府、科研單位應該大力鼓勵和支持企業嘗試、發展工廠化養殖，就有關技術難題進行聯合攻關。
