蚯蚓數代混養，近親繁殖，易引起種性退化，蚯蚓個體重量，產卵率和孵化率都會下降，甚至會大量逃逸或死亡，因此要采取分群養殖。在生產上，可把蚯蚓分為種蚓群、繁殖群和生產群。種蚓群要選擇種性好、健壯、活動力強的幼蚓做種蚓，防止品種退化：繁殖群由種蚓群輸送來的成年蚯蚓組成，專門為生產群提供卵塊，保證蚯蚓的整齊一致；生產群由繁殖群提供的卵塊，集中孵化的幼蚓組成，飼養為成蚓。
種蚓群最好用箱（筐、缸）養殖，繁殖群可采用室內多層架床式養殖，生產群可在室內或室外養殖。養殖的密度，種蚓群每平方米可為1000條左右，繁殖群每平方米為5000條左右，生產群每平方米為2萬條左右。
據各地經驗，種蚓群與繁殖群飼養數量的比例為1：l00，繁殖群與生產群飼養數量的比例為1：50。例如，每天要生產蚯蚓15萬條（約150斤），種蚓群就要有1500條成熟蚯蚓，繁殖群就要有15萬條的蚯蚓產卵。種蚓群成熟蚯蚓的數量少，會影響繁殖群的整齊度。種蚓群，繁殖群和生產群飼養條數的比例不是固定不變的，可在生產過程中加以調整。
蚯蚓成熟后，產卵的高峰一般只有八個月左右，隨后產卵的數量減少，因此，對種蚓群和繁殖群中已老化的蚯蚓要不斷更新，才能使生產群中的蚯蚓生長迅速，體重增加。更新的方法，一是經常從種蚓群繁殖的后代中挑選個體粗大，性狀一致的成熟蚯蚓進行補充，其余送到繁殖群：二是在捕集生產群的成蚓時，挑選個體大、種性優良的成熟蚯蚓，作為種蚓群或繁殖群飼養；三是在蚯蚓繁殖較慢的冬季進行一次性更新。
