由于麝鼠的人工馴化時間不長，有的麝鼠野性較強，比較怕人，聽到聲響或有人近前就迅速鉆入小室躲藏起來。尤其在冬季或生病時，麝鼠更是不愿出窩活動，而且人工建造的窩室多用磚砌成，不易隨時查看，使得飼養管理人員不能經常了解其各種情況，并發生過死鼠在窩內多日不知道的現象。為了防止這些現象的發生以減少損失，并及時準確掌握麝鼠的生長發育狀況，除了在日常的飼養中細心觀察，還應及時對麝鼠進行定期檢查，時間最好為1周1次，冬季為了保溫可以10-15天1次。檢查與喂食和清掃窩室同時進行，檢查者打開室蓋上的觀察扎，察看室內是否有剩食，有無惡臭味，衛生狀況如何，并將麝鼠趕至運動場，觀察其精神狀態和被毛，并做好記錄。檢查項目如下：
①麝鼠的精神狀態。正常的麝鼠精神狀態良好，運動姿式協調，當有人接近或被術棍驅趕時，在舍內快速運動，或躲藏逃避，有的對人或木棍表現出咬斗的架式。當發生疾病時，則躲于一邊不愿挪動．同時對周圍環境的刺激反應遲鈍。
②被毛和皮膚狀況。被毛和皮膚的異常變化，是皮膚被毛疾病，維生素缺乏癥，或營養代謝疾病的表現。健康麝鼠的被毛平順靈活，針毛光亮，皮膚富有彈性。當麝鼠長期營養不良或患有慢性疾病時，則被毛蓬亂無光，長短不一。正常狀態下麝鼠的鼻鏡較為濕潤，當高度營養缺乏，下痢失水，中暑及患有巴氏桿菌病等傳染性疾病時，鼻鏡變得干燥，胃腸炎引起的下痢，窩室潮濕衛生狀況嚴重不佳時，易使麝鼠的腹部、后肢和臀部被毛浸濕，污染，影響毛皮質量。
③食欲和糞便。麝鼠采食量和糞便的變化常常是鼠體健康和疾病的象征。影響食欲的因素很多，當麝鼠患有某種急熱性傳染病時可引起食欲的廢絕，感冒、氣溫過高以及消化不良等則常使食欲減退。當牙齒過長或口舌生病時，雖有食欲，但采食咀嚼有困難常有剩食。
