目前采用的配種方法主要有四種，即單雄單雌配種、單雄群雌配種、群雄群雌配種和人工受精配種。生產中具體采用哪種方法配種，應根據各方面條件，綜合權衡，因地制宜的選擇確定。
(1)單公單母配種法。該法就是把發情的母麝和經過挑選的種公麝．1對1地撥到指定周內進行交配。運用此法配種需注意兩點：一是要準確掌握母麝發情時機，特別是對一些隱性發情者，一定要仔細察看弄確實；二是對公麝的精液進行檢查，只有符合要求后才能單獨放對，確保受孕。此法雖然系譜清楚，但比較繁瑣費事，需經常撥進撥出，工作量很大，有時甚至不能及時收到配種效果。
(2)單公群母配種法。
首先將母群按照年齡、生產需要以及身體狀況等分成若干個配種小群，每個小群數量可為4-6只，也可10-12只。4-6只的小群可由一頭公麝配到底．10-12只母群可由兩頭公麝輪流交配，其具體做法是：1次只放入1頭公麝，每隔5-6天更換1次，到母麝發情旺期則2-3天更換1次；當1天之內公麝已交配4-5次后，仍有母麝發情需交配時，應將該公麝撥出，放進另一頭公麝進行交配，以保持公麝的體質和交配質量。
運用該配種法的好處是：①記錄清晰，資料完整，系譜清楚，不易造成近親繁殖；②公麝輪流單放，避免彼此爭斗而發生傷亡；③操作簡便，省時省事；④公麝利用率高，受配率也較高。不足之處是：母麝如發情太集中，公麝配種太頻繁，容易漏配；配種時需用圈舍和設備較多；配種期間需用勞力較多。
(3)群公群母配種法。該法就是將群公群母按1:4-6的比例，一次合群，直到配種結束，在整個配種期內，如發現公麝患病、性欲不高、配種表現不好或爭斗受傷，應及時撥出，一般不再補充，如撥出公麝過多，可酌情新增一些公麝投入配種。
