孵化的第12～13天，是羊膜道與羊膜腔連通，蛋白開始流進羊膜腔直接被胚胎吞食，胚胎開始了出殼前的腸管營養時期，這是一個關鍵的轉折階段。如果此時溫度、濕度不正常，將影響羊膜道與羊膜腔的連通，蛋白進不到羊膜腔被胚胎利用或蛋白代謝受阻，常會造成中胚大批死亡。這是雞胚胎發育的第二個危險時期。
孵化的第19～20天，這時尿囊萎縮，尿囊血管的呼吸機能消失，雞胚胎由尿囊呼吸轉變為肺呼吸，需要大量氧氣。此時如果通風不良，氣體代謝發生障礙，如肺部或氣管中尚有蛋白堵塞，或胎位不正，喙部不能進入氣室利用氣室中的氧氣，胚胎即會死亡。此時如果溫度過高，胚胎呼吸加快，而氧氣量不夠，亦會造成胚胎死亡。這是雞胚胎發育的第三個危險時期。
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