接種時應注意：①準備好樹皮蓋，樹皮蓋應比穴孔大3毫米，一般提前1～2天打好蓋，用開水消毒晾干備用，②打穴應自段木二端2-3厘米處開始，穴徑12-15毫米，深12毫米以上，行距50-60毫米，穴距60-80毫米，穴應互相錯開成梅花形，損傷處要打穴接入菌種。⑧選擇晴暖天氣，在蔭處或屋內接種，避免陽光直曬和雨淋，操作者的雙手和工具要先經消毒，菌種要隨取隨用，打穴與接種密切配合，菌種應成塊接入，松緊適度，蓋上樹皮蓋后用錘輕輕打平。
集堆發菌管理。堆場應選擇清潔、干燥處，撒上石灰，用石塊平行墊放2根直徑約10厘米的橫木，再將接好種的段木密集一順式堆放于橫木上，在堆頂和四周覆裹一層薄膜，再用茅草等覆蓋嚴實，以利保溫、保溫。適宜毛木耳菌絲生長的溫度是20-28℃，最適為25℃，最適空氣濕度是65-70%，要創造合適的溫濕度條件。根據堆內溫、濕度的情況，靈活掌握噴水次數，一般接種10天后須噴水一次，以后每隔7-10天再噴水一次，噴水量要視耳木的干濕情況靈活掌握。結合噴水進行翻堆互換位置，檢查菌線的生長情況。發現耳木有霉菌，則說明濕度過大，要注意適當通風，并用毛刷蘸石灰干粉擦凈霉菌。
進棚出耳管理。一般經40-70天的集堆發菌，在5-6月接種穴處長出耳芽，如果耳芽數量少，說明菌絲尚未充分成熟，不要急于排架出耳，待大量現耳芽時，再將耳木搬入棚內以“人”字起架出耳。此時可用竹尾尖釘入耳木兩端，這樣起架時可使耳木高出地面15-20厘米，便于耳木二端的出耳管理，還可避免耳木直接接觸地面遭蟲害和腐爛。出耳期間正值高溫季節，此時要注意噴水保濕，一般早、晚噴火水一次，中午讓其干燥，干干濕濕、干濕交替可促使耳片迅速長大。采耳后要停水5-7天，開大棚門加強通風，使耳木表面干燥，促使菌絲向縱深長入耳木內部，然后倒頭再噴人大水，又能長出許多耳芽。耳芽一般經10天便能伸展長大，凡長大的木耳要及時采收。采耳時要連耳基一起摘掉，以免潰爛引起流耳。
